Hereditárny difúzny karcinóm žalúdka/HBOC
Rozsah vyšetrenia: CDH1 - kódujúca sekvencia
Analyzačná metóda: Masívne paralelné sekvenovanie, priame sekvenovanie
Hereditary diffuse gastric cancer (https://omim.org/entry/137215) is an autosomal dominant cancer predisposition syndrome. Heterozygous CDH1 mutation carriers have a 70 to 80% lifetime risk of developing diffuse gastric cancer. In addition to gastric cancer, up to 60% of female mutation carriers develop lobular carcinoma of the breast, and some carriers may develop colorectal cancer. Identification of mutation carriers is important, because the characteristic microscopic foci of signet ring cell adenocarcinoma in HDGC usually involves the submucosa and is often not readily detectable by routine upper endoscopy screening (summary by Fitzgerald et al., 2010).
HDGC is considered to be a distinct disease entity from the more common sporadic occurrence of gastric cancer (613659), which can be associated with environmental factors, such as Helicobacter pylori infection, high-fat diet, or smoking, and is often associated with somatic mutations in disease tissue.
K vyšetreniu je potrebná indikácia klinického genetika a nutné absolvovať genetickú konzultáciu.
Zoznam ambulancií klinickej genetiky nájdete na http://sslg.sk/index.php/sslg/pracoviska.
Periférna krv
- 1-2 ml žilovej krvi do skúmaviek s EDTA (napr. Vacutainer – ružový vrchnák), používané aj na krvný obraz
- po odbere krátkodobo (2-5 dní) skladovať pri 4-8°C, príp. pri izbovej teplote – max. 24 hod.
- štandardne nemraziť, v prípade zmrazenia je nutné transportovať zmrazené, opakované zmrazovanie degraduje DNA
- transport – krátkodobý pri bežnej teplote, aj poštou (1-2 dni), dlhodobý pri 4-8°C
Bukálny ster:
1. Pred odberom približne hodinu nič nejedzte ani nepite. Optimálne podmienky na odber sú ráno pred umytím zubov.
2. Otvorte sáčok s odberovou súpravou a opatrne vyberte vrchnák s tyčinkou z tuby.
3. Opakovanými krúživými pohybmi hore-dolu (asi 10x) stierajte v ústnej dutine povrch vnútornej strany líca tak, aby bol celý povrch tampónu pokrytý.
4. Následne tyčinku opatrne vložte do príslušnej tuby a v horizontálnej polohe nechajte sušiť aspoň jednu hodinu.
5. Tubu označte menom vzorky.